Sin Dioses (Publicaciones sobre CB200)

CB200: Algunos sistemas son irreduciblemente complejos

Mark Isaak. traducción de Samuel Martínez de la Iglesia — Thu, 19 Jul 2007 03:00:00 GMT

Algunos sistemas bioquímicos son irreduciblemente complejos, lo que significa que la eliminación de alguna de las partes del sistema destruiría la función del sistema. La complejidad irreducible elimina la posiblidad de que un sistema haya evolucionado, por lo que tiene que haber sido diseñado.

Fuente:

Behe, Michael J. 1996. Darwin's Black Box, New York: The Free Press.

Respuesta

Los sistemas irreduciblemente complejos pueden evolucionar. Son definidos como sistemas que pierden su función si alguna de sus partes es eliminada. Ésto lo único que indica es que el sistema no evolucionó por la adición de partes simples sin ningún cambio en su función, siendo aún posibles varios mecanismos evolutivos como los siguientes:
- Eliminación de alguna de sus partes.
- Adición de múltiples partes; por ejemplo, la duplicación de la mayoría del sistema. ([Pennisi_2001])
- Cambio de función.
- Adición de una segunda función a una de las partes del sistema. ([Aharoni_et_al_2004])
- Modificación gradual de las partes.
Todos estos mecanismos han sido observados como resultado de mutaciones genéticas. En particular, las deleciones y las duplicaciones génicas son muy comunes ([Dujon_et_al_2004]; [Hooper_and_Berg_2003]; [Lynch_and_Connery_2000]), y conjuntamente hacen que la complejidad irreducible no solo sea posible sino esperable. De hecho, esto fue predicho por el genetista y ganador del premio Nobel, Hermann Muller hace casi cien años ([Muller_1918], 463-464). Muller se refería a ello como complejidad vinculada (interlocking complexity), ([Muller_1939]).

Los orígenes evolutivos de algunos sistemas irreduciblemente complejos han sido descritos con detalle. Por ejemplo, la evolución del Ciclo de Krebs o Ciclo del ácido cítrico ([Melendez_Hevia_et_al_1996]) o la de un sistema "irreducible" como el del sistema hormona-receptor ([Bridgham_et_al_2006]). La irreducibilidad no es un obstáculo para su formación.
Incluso si la irreducibilidad prohibiese la evolución darwiniana, la conclusión de diseño no se deriva de ello. Otros procesos pueden haberla producido. La complejidad irreducible es un ejemplo de la falacia divina o argumento de incredulidad personal.
La complejidad irreducible no está bien definida. Está definida en términos de partes, pero no es nada obvio a que se refiere con parte. De forma lógica, las partes deberían ser átomos individuales, porque representan el nivel de organización básica (que no se subdivide más) en bioquímica y es el nivel más pequeño que los bioquímicos consideran en sus análisis. Behe, sin embargo, considera conjuntos de moléculas como partes individuales, y no indica como hace sus determinaciones.
Algunos sistemas que se han considerado irreduciblemente complejos, en realidad pueden no serlo. Por ejemplo:
- La ratonera que Behe usó como ejemplo de complejidad irreducible puede ser simplificada doblando la varilla y eliminando el cerrojo.
- El flagelo bacteriano no es irreduciblemente complejo porque puede perder varias partes y seguir funcionando, bien como un flagelo más simple o como un complejo de secrección. Muchas proteínas del flagelo eucariota (también llamado cilio, o undulipodio) se sabe que no son indispensables, porque se conocen flagelos funcionales más simples que no tienen estas proteínas.
- El transporte de proteínas: a pesar de ser un ejemplo de complejidad irreducible de Behe, hay otras proteínas que no requieren transporte (ver [Ussery_1999]).
- Otro ejemplo que incluyó Behe en su libro: el sistema inmune. No es irreduciblemente complejo porque los anticuerpos que marcan las células invasoras para su posterior destrucción pueden, por ellas mismas obstaculizar la función de las células invasoras, permitiendo al sistema inmune funcionar (aunque no tan bien) sin las moléculas que las destruyen.

Enlaces

Archivo TalkOrigins. Irreducible complexity and Michael Behe. http://www.talkorigins.org/faqs/behe.html

Referencias

[Aharoni_et_al_2004]

Aharoni, A., L. Gaidukov, O. Khersonsky, S. McQ. Gould, C. Roodveldt and D. S. Tawfik. 2004. The evolvability of promiscuous protein functions. Nature Genetics

[Bridgham_et_al_2006]

Bridgham, Jamie T., Sean M. Carroll and Joseph W. Thornton. 2006. Evolution of hormone-receptor complexity by molecular exploitation. Science 312: 97-101. Ver también Adami, Christopher. 2006. Reducible complexity. Science 312: 61-63.

[Dujon_et_al_2004]

Dujon, B. et al. 2004. Genome evolution in yeasts. Nature 430: 35-44

[Hooper_and_Berg_2003]

Hooper, S. D. and O. G. Berg. 2003. On the nature of gene innovation: Duplication patterns in micobial genomes. Molecular Biology and Evolution 20(6): 945-954.

[Lynch_and_Connery_2000]

Lync, M. and J. S. Conery. 2000. The evolutionary fate and consequences of duplicate genes. Science 290: 1151-1155. Ver también Pennisi, E. 2000. Twinned genes live life in the fast lane. Science 290: 1065-1066.

[Melendez_Hevia_et_al_1996]

Meléndez-Hevia, Enrique, Thomas G. Waddell and Marta Cascante. 1996. The puzzle of the Krebs citric acid cycle: Assembling the pieces of chemically feasible reactions, and opportunism in the design of metabolic pathways during evolution. Journal of Molecular Evolution 43(3): 293-303.

[Muller_1918]

Muller, Hermann J. 1918. Genetic variability, twin hybrids and constant hybrids, in a case of balanced lethal factors. Genetics 3: 422-499 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1200446/

[Muller_1939]

Muller, H. J. 1939. Reversibility in evolution considered from the standpoint of genetics. Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society 14: 261-280.

[Pennisi_2001]

Pennisi, Elizabeth. Genome duplications: The stuff of evolution? Science 294: 2458-2460.

[Ussery_1999]

Ussery, David. 1999. A biochemist`s response to The biochemical challenge to evolution. Bios 70: 40-45. http://www.indiana.edu/~ensiweb/behe.rev.html

Otras lecturas

Gray, Terry M. 1999. Complexity--yes! Irreducible--maybe! Unexplainable--no! A creacionist criticism of irreducible complexity. http://www.asa3.org/evolution/irred_compl.html

Lindsay, Don. 1996. Review:Darwin`s black box, the biochemical challenge to evolutio by Michael Behe. http://www.don-lindsay-archive.org/creation/behe.html.

Miller, K. 1999. Finding Darwin`s God. Harper-Collins, chap. 5.

Shanks, N. and K. H. Joplin. 1999. Redundant complexity: A analysis of intelligent design in biochemistry. Philosophy of Science 66: 268-298.

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CB200.1.1: El flagelo tiene aproximadamente 30 proteínas únicas (no-homólogas)

Mark Isaak. traducción de Samuel Martínez de la Iglesia — Sat, 09 Sep 2006 03:00:00 GMT

Los evolucionistas proponen que los sistemas irreduciblemente complejos pueden aparecer por la exaptación (utilización de una adaptación preexitente para una nueva función) de partes de otros sistemas existentes. Pero aproximadamente 30 de las proteínas que se necesitan para el correcto funcionamiento del flagelo le son únicas; proteínas similares no se encuentran en otros sistemas vivos. Por tanto, no es posible que apareciesen por exaptación.

Fuente:

Minnich, Scott A., 2003. Unlocking the Mystery of Life (video), Illusta Media. https://www.youtube.com/watch?v=tzj8iXiVDT8 ; http://www.discovery.org/a/2116/

Minnich, Scott A. and Stephen C. Meyer. 2004. Genetic analysis of coordinate flagellar and type III regulatory circuits in pathogenic bacteria. Second International Conference on Design and Nature, http://www.discovery.org/a/2181

Respuesta

Esta afirmación es simplemente falsa. De las 20 proteínas en el flagelo bacteriano de Salmonella que se requieren en todos los demás flagelos bacterianos, solo 2 de ellas no tienen proteínas homólogas conocidas, es decir, son "únicas". Es, al menos, plausible esperar encontrar estas proteínas homólogas en un futuro. Al menos nueve proteínas flagelares son homólogas a las proteínas del complejo de secrección Tipo III (T3SS), sugirendo que evolucionaron de un ancestro común. De cualquier manera, la existencia de varias proteínas homólogas demuestra que las partes del flagelo pueden funcionar para otros propósitos aparte de la movilidad ([Pallen_and_Matzke_2006]).
No existe tal cosa como "el" flagelo bacteriano. Hay miles, quizá millones de variedades entre las diferentes bacterias, sin mencionar otros tipos completamente distintos de flagelo en arqueas y eucariotas. El flagelo de Salmonella, por ejemplo, tiene 22 proteínas adicionales que otras bacterias no tienen en sus respectivos flagelos. ¿Proponen los defensores del diseño que cada una fue una creación separada o que evolucionaron de un ancestro común? ([Pallen_and_Matzke_2006]).

Enlaces

Matzke, Nick, 2006. Flagellum evolution in Nature Reviews Microbiology. http://www.pandasthumb.org/archives/2006/09/flagellum_evolu.html

Referencias

[Pallen_and_Matzke_2006] (1,2)

Pallen, Mark J. and Nicholas J. Matzke. 2006, 5 Sept. From The Origin of Species to the origin of bacterial flagella. Nature Reviews Microbiology, (epub.)

Otras lecturas

Matzke, N. J. 2003. Evolution in (Brownian) space: A model for the origin of the bacterial flagellum. http://www.talkdesign.org/faqs/flagellum.html

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CB200.2: El sistema de coagulación es irreduciblemente complejo

Mark Isaak. traducción de Samuel Martínez de la Iglesia — Sat, 24 Sep 2005 03:00:00 GMT

La bioquímica del sistema de coagulación sanguíneo es irreduciblemente complejo, lo que indica que debe haber sido diseñado.

Fuente:

Behe, Michael J. 1996. Darwin's Black Box, New York: The Free Press, pp. 74-97

Respuesta

Los sistemas de coagulación sanguíneos parecen estar elaborados usando cualquier puente polimérico que sea útil. Hay muchos ejemplos de sistemas complicados hechos con componentes que tienen roles útiles pero completamente diferentes en otros sistemas diferentes. Hay evidencia, también, de que los genes del sistema de coagulación de la sangre (en efecto, el genoma entero) fueron duplicados dos veces en el curso de su evolución ([Davidson_et_al_2003]). La duplicación de partes y el cambio de función y adaptación (exaptación) de otras partes con funciones diferentes puede fácilmente sortear la "dificultad" de la evolución gradual de los sistemas irreduciblemente complejos.
El sistema de coagulación de la sangre no es irreduciblemente complejo. Algunos animales —como los delfines, por ejemplo— se las arreglan bastante bien sin el factor de Hagemann ([Robinson_et_al_1969]), un componente del sistema de coagulación sanguíneo humano que Behe incluyó en sus ejemplos de complejidad "irreducible" (Behe 1996, 84). Doolittle y Feng ([Doolittle_Feng_1987]) predijeron que los vertebrados "inferiores" carecerían de la vía intrínseca de la cascada de coagulación. Sendos trabajos sobre los genomas del pez globo y el pez cebra han confirmado este hecho ([Yong_Doolittle_2003]).
La complejidad irreducible no es un obstáculo para la evolución y no implica diseño.

Enlaces

Acton, George, 1997. Behe and the blood clotting cascade. http://www.talkorigins.org/origins/postmonth/feb97.html

Behe, M. and K. Miller. 2002. Transcript: American Museum of Natural History April 23, 2002 (Part 7). http://ncse.com/book/export/html/1740

Dunkelberg, Pete, 2003. Irreducible complexity demystified. http://www.talkdesign.org/faqs/icdmyst/ICDmyst.html

EvoWiki, 2004. Blood clotting. http://evolutionwiki.org/wiki/Blood_clotting

Musgrave, Ian, 2005. Clotted rot for rotten clots. http://www.pandasthumb.org/archives/2005/03/clotted_rot_for.html

Referencias

[Davidson_et_al_2003]

Davidson, C. J., E. G. Tuddenham, and J. H. McVey. 2003. 450 million years of hemostasis. Journal of Thrombosis and Haemostasis 1: 1478-1497

[Doolittle_Feng_1987]

Doolittle R. F., Feng D. F. 1987. Progressive sequence alignment as a prerequisite to correct phylogenetic trees. Journal of molecular evolution 25(4): 351-60

[Robinson_et_al_1969]

Robinson, A. J., M. Kropatkin, and P. M. Aggeler. 1969. Hagemann factor (factor XII) deficiency in marine mammals. Science 166: 1420-1422.

[Yong_Doolittle_2003]

Yong Jiang, Doolittle R. F. 2003 Jun 24. The evolution of vertebrate blood coagulation as viewed from a comparison of puffer fish and sea squirt genomes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 100(13): 7527-32. (Epub 2003 Jun 13)

Otras lecturas

Doolittle, Russell F., 1997. A delicate balance. Boston Review (Feb./Mar.), http://new.bostonreview.net/BR22.1/doolittle.html

Ussery, David, 1999. A biochemist's response to "The biochemical challenge to evolution". Bios 70: 40-45.

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CB200.4: El sistema inmunológico es irreduciblemente complejo.

Mark Isaak. traducción de Samuel Martínez de la Iglesia — Tue, 28 Jun 2005 03:00:00 GMT

El sistema inmunológico de los humanos es irreduciblemente complejo, indicando que debe haber sido diseñado.

Fuente:

Behe, Michael J. 1996. Darwin's Black Box, New York: The Free Press, páginas 117-139

Respuesta

El sistema del complemento del sistema inmunitario no es irreduciblemente complejo. El sistema del complemento de los urocordados es funcional, aunque carece de uno de los componente de la cascada bioquímica de dicho sistema en humanos.
Algunos mecanismos comunes, como la duplicación génica y la exaptación de moléculas con distinta función, hacen posible que el sistema inmunológico evolucione de forma natural. Mucho ha sido escrito con relación a este tema ([Kasahara_et_al_1997]; [Lindsay_1999]; [Travis_1998])
Behe está equivocado en algunos de los conceptos básicos de biología. Las bacterias no se destruyen, como dice (1996, 134), a causa de la entrada del agua cuando la membrana celular es perforada, si no por la destrucción de su gradiente electroquímico ([Ussery_1999]).
La complejidad irreducible no supone un obstáculo para la evolución y no implica diseño.

Enlaces

Bottaro, Andrea. 2005 (May 30). The revenge of Calvin and Hobbes. http://www.pandasthumb.org/archives/2005/05/the-revenge-of.html Ver también: Bottaro, Andrea. 2005 (June 2). Behe's meaningless complexity. http://www.pandasthumb.org/archives/2005/06/behes_meaningle.html

Coon, Mike, 1998. Is the complement system irreducibly complex? http://www.talkorigins.org/faqs/behe/icsic.html

Inlay, M., 2002. Evolving immunity. http://www.talkdesign.org/faqs/Evolving_Immunity.html

Referencias

[Kasahara_et_al_1997]

Kasahara, M. et al. 1997. Chromosomal duplication and the emergence of the adaptive immune system. Trends in Genetics 13(3): 90-92.

[Lindsay_1999]

Lindsay, Don, 999. How could the immune system evolve? http://www.don-lindsay-archive.org/creation/evolve_immune.html

[Travis_1998]

Travis, John, 1998. The accidental immune system. Science News 154: 302-303.

[Ussery_1999]

Ussery, David, 1999. A biochemist's response to "The biochemical challenge to evolution". Bios 70: 40-45

Otras lecturas

Ussery, David. 1999 (vide supra). http://www.cbs.dtu.dk/staff/dave/Behe.html

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CB211: La estructura proteica de un receptor antigénico es idéntica en camellos y tiburones.

Mark Isaak. traducción de Samuel Martínez de la Iglesia — Mon, 05 Apr 2004 03:00:00 GMT

Una peculiar estructura proteica de receptor antigénico es compartida por camellos y tiburones nodriza ([Roux_et_al_1998]). Esta, y otras muchas similitudes, no pueden ser explicadas por un antepasado común.

Fuente:

Sarfati, Jonathan, 2002. Refuting Evolution 2. Green Forest, AR: Master Books, p. 113.

Respuesta

Se sabe desde hace mucho tiempo que la evolución convergente sucede en grandes estructuras, como en las alas de los murciélagos y los pájaros. También desde hace tiempo se la ha esperado hallar en la estructura de moléculas. Roux et al. (1998) dijeron, "La convergencia evolutiva en el nivel molecular está presuntamente generalizada, pero está poco documentada". La proteína que ellos describen es un ejemplo.

Las semejanzas pueden ser explicadas por la evolución como debidas a la herencia, la convergencia o el azar. En el caso de la convergencia, se esperan presiones selectivas similares en organismos semejantes como también se espera que no haya semejanza en pequeños detalles de la estructura. Esto es lo que se observa aquí. Las secuencias de ADN que codifician las proteínas de esta estructura en tiburones son diferentes de las de camello ([Roux_et_al_1998]).

Referencias

[Roux_et_al_1998] (1,2)

Roux, Kenneth H. et al. 1998. Structural analysis of the nurse shark (new) antigen receptor (NAR): Molecular convergence of NAR and unusual mammalian immunoglobulins. Proceedings of the National Academy of Science USA 95(20): 11804-11809. http://www.pnas.org/cgi/content/full/95/20/11804

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CB200.1: El flagelo bacteriano es irreduciblemente complejo

Mark Isaak. traducción de Samuel Martínez de la Iglesia — Mon, 15 Dec 2003 03:00:00 GMT

El flagelo bacteriano y los cilios eucariotas son irreduciblemente complejos. Como las formas intermedias no funcionales no pueden ser preservadas por la selección natural, estos sistemas solo pueden ser explicados mediante el diseño inteligente.

Fuente:

Behe, Michael J. 1996. Darwin's Black Box, New York: The Free Press, pg: 59-73.

Respuesta

Este es un ejemplo del argumento de incredulidad personal, porque la complejidad irreducible puede evolucionar de forma natural. Muchas de las proteínas que se encuentran en el flagelo bacteriano o en el cilio eucariota son similares entre sí y con proteínas con otras funciones. Sus orígenes pueden ser facilmente explicados por una serie de duplicaciones génicas seguidas por un proceso de modificación y/o exaptación de la extructura, ocurriendo esto gradualmente a través de estados intermedios diferentes y más simples que el flagelo final.

La posible ruta evolutiva del flagelo puede haber seguido las siguientes etapas (recordad que es un resumen, y cada proceso importante de cambio de función de una adaptación biológica es seguido de largos períodos de optimización gradual de la función):
1. Un poro en la membrana plasmática (transporte pasivo y no específico) evoluciona en un poro más específico por la adición de proteínas compuerta. Posteriormente el transpore pasivo se convierte en transporte activo por adición de una ATPasa que usa la energía de la hidrólisis del ATP para exportar moléculas fuera del interior de la célula. Este complejo forma un complejo de secrección tipo III primitivo.
2. El complejo secretorio tipo III primitivo se convierte en el complejo de secrección tipo III (T3SS o inyectisoma) por la adición de proteínas del poro de la membrana externa (secretina y chaperona) desde el complejo de secrección tipo II. Esto, eventualmente forma los anillos P y L, respectivamente, del flagelo moderno. El complejo de secrección tipo III moderno tiene una estructura sorprendentemente similar a las estructuras de la viela y el anillo del flagelo ([Hueck_1998]; [Blocker_et_al_2003]).
3. El T3SS secreta varias proteínas, una de ellas es una adhesina (una proteína que sirve para que la célula se adhiera a otras células o a un substrato). La polimerización de esta adhesina forma un pilus primitivo, una extensión que aumenta la capacidad de adhesión de la célula. Después de la esta gradual evolución del pilus T3SS, este, mediante duplicación y subfuncionalización de las proteínas que lo componen (pilinas) adquiere varias nuevas tareas más especializadas.
4. Un complejo de bomba de iones con otra función en la célula, se asocia fortuitamente con la base de la estructura de secrección, convirtiendo el pilus en un protoflagelo primitivo (protofilamento). La función inicial del protoflagelo es mejorar la dispersión. Actuamente, se sabe que proteínas homólogas de las proteínas motoras MotA y MotB se encuentran y tienen función en varios organismos procariotas independientemente de si tienen flagelo o no.
5. La unión de una proteína de transducción de señales a la base del sistema de secrección regula la velocidad de rotación dependiendo del estado metabólico de la célula. Esto promueve una deriva (de movimiento) hacia las regiones favorables y lejos de las regiones pobres en nutrientes, tales como en los que hay superhábit de bacterias. Esto supone el principio de la movilidad quimitáctica.
6. Varias mejoras siguieron después del origen de esta función incipiente. Notablemente, muchas de las diferentes proteínas axiales (el filamento, el engranaje, los conectores, el capuchón) se originaron por la duplicación y subfuncionalización de las pilinas de la estructrua axial primitiva del flagelo. Estas proteínas acabaron formando la familia de proteínas axiales.
El cilio eucariota (también llamado flagelo o undulipodio) es sustancialmente diferente del flagelo bacteriano. Probablemente se originó como una extensión del huso mitótico en un eucariota primitivo (ambas estructuras hacen uso de los microtúbulos y las dineinas). Cavalier-Smith ([Cavalier_Smith_1987]; [Cavalier_Smith_2002]) ha debatido acerca del origen de estos sistemas en varias ocasiones.
El flagelo bacteriano no es irreducible. Algunos flagelos bacterianos funcionan sin los anillos L y P. En experimentos con varias bacterias, se ha descubierto que algunos componentes (como el FliH, FliD (cap) y el dominio muramidasa (o lisozima) de FlgJ) son útiles pero absolutamente imprescindibles ([Matzke_2003]). Un tercio de los 497 aminoácidos del flagelo fueron eliminados sin dañar su función ([Kuwajima_1988]). Además, muchas bacterias tienen proteínas adicionales que se necesitan para su propio flagelo pero no se requieren en el flagelo "estándar" de Escherichia coli. Bacterias diferentes tienen diferente numero de proteínas flagelares (en Helicobacter pylori, por ejemplo, solo son necesarias 33 proteínas para producir un flagelo funcional), así que el ejemplo favorito de Behe de complejidad irreducible en realidad parece exhibir bastante variabilidad en términos de cantidad de partes necesarias ([Ussery_1999]).

El cilio eucariota está formado por más de 200 proteínas distintas, pero incluso aquí la irreducibilidad es solo una ilusión. Behe (1996) insinuó y, previamente, Denton ([Denton_1986], 108) expuso explícitamente que la estructura común de la tubulina 9+2 del cilio no podría ser simplificada de forma sustancial. No obstante, se conocen cilios funcionales 3+0, sin muchos de los microtúbulos ni de las dineínas (que sirven de unión) ([Miller_2003]; [Miller_2004]).
El flagelo de las bacterias, el de las arqueas y el cilio tienen configuraciones completamente distintas para la misma función. Este hecho es de esperar si se considera que evolucionaron de forma separada, pero no tendría ningún sentido si se tratase del trabajo del mismo diseñador.

Enlaces

Matzke, N. J. 2003. Evolution in (brownian) space: a model for the origin of the bacterial flagellum. http://www.talkdesign.org/faqs/flagellum.html o también http://www.talkreason.org/articles/flag.pdf (ver también 'Background to "Evolution in (Brownian) space"', http://www.talkdesign.org/faqs/flagellum_background.html o también http://www.talkreason.org/articles/flagback.cfm)

Dunkelberg, Pete. 2003. Irreducible complexity demystified. http://www.talkdesign.org/faqs/icdmyst/ICDmyst.html

Musgrave, Ian. 2000. Evolution of the bacterial flagella. http://www.health.adelaide.edu.au/Pharm/Musgrave/essays/flagella.htm

Referencias

[Blocker_et_al_2003]

Blocker, Ariel, Kaoru Komoriya, and Shin-Ichi Aizawa. 2003. Type III secretion systems and bacterial flagella: Insights into their function from structural similarities. Proceedings of the National Academy of Science USA 100(6): 3027-3030 http://www.pnas.org/cgi/content/full/100/6/3027

[Cavalier_Smith_1987]

Cavalier-Smith, T. 1987. The origin of eukaryote and archaebacterial cells. Annals of the New York Academy of Sciences 503: 17-54.

[Cavalier_Smith_2002]

Cavalier-Smith, T. 2002. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52: 297-354.

[Denton_1986]

Denton, M. 1986. Evolution: A Theory in Crisis. Bethesda, MD: Adler & Adler.

[Hueck_1998]

Hueck, C. J. 1998. Type III protein secretion systems in bacterial pathogens of animals and plants. Microbiology and Molecular Biology Reviews 62: 379-433.

[Kuwajima_1988]

Kuwajima, G. 1988. Construction of a minimum-size functional flagellin of Escherichia coli. Journal of Bacteriology 170: 3305-3309.

[Matzke_2003]

Matzke, N. J. 2003. (vide supra)

[Miller_2003]

Miller, K. 2003. Answering the biochemical argument from design. in: Manson, N. (Ed.), God and design: the teleological argument and modern science, Routledge, London, pg. 292-307.

[Miller_2004]

Miller, K. 2004. The flagellum unspun. En Debating Design: from Darwin to DNA, 81-97, eds. Dembski, W., and M. Ruse, New York: Cambridge University Press. http://www.millerandlevine.com/km/evol/design2/article.html

[Ussery_1999]

Ussery, David. 1999. (vide infra)

Otras lecturas

Ussery, David. 1999. A biochemist's response to "The biochemical challenge to evolution". Bios 70: 40-45. http://www.indiana.edu/~ensiweb/behe.rev.html

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CB200.3: El transporte de proteínas dentro de una célula es irreduciblemente complejo.

Mark Isaak. traducción de Samuel Martínez de la Iglesia — Wed, 03 Sep 2003 03:00:00 GMT

La bioquímica en el transporte de proteínas del interior de la célula es irreduciblemente compleja, indicando que debe haber sido deiseñada.

Fuente:

Behe, Michael J. 1996. Darwin's Black Box, New York: The Free Press, páginas 98-116

Respuesta

A pesar de la complejidad del sistema que describe Behe, el transporte proteíco no tiene por qué ser tan complejo. Algunas proteínas dirigen su propia secrección de tal forma que no se necesita ningún mecanismo de transpore (ver referencias en [Ussery_1999]). Ciertamente, son posibles otros sistemas más simples que pudiesen servir como precursores al transporte vesicular.
Muchas de las proteínas del transporte en células eucariotas tienen ''ancestros'' moleculares en bacterias. Estas moléculas, los transportadores ABC, tienen función en un sistema mucho más simple. Si Behe estuviese interesado en los sistemas más simples que tienen función, ¿por qué ni siquiera los menciona?
La complejidad irreducible no supone un obstáculo para la evolución y no implica diseño.

Referencias

[Ussery_1999]

Ussery, David. 1999. A biochemist`s response to The biochemical challenge to evolution. Bios 70: 40-45. http://www.indiana.edu/~ensiweb/behe.rev.html

Otras lecturas

Ussery, David. 1999 (vide supra).

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CB200.5: La ruta metabólica de la síntesis de AMP es demasiado compleja para haber evolucionado

Mark Isaak. traducción de Samuel Martínez de la Iglesia — Wed, 27 Aug 2003 03:00:00 GMT

La ruta metabólica para sintetizar AMP es demasiado compleja para haber evolucionado. Requiere varios pasos intermedios y es altamente improbable que todos ellos hayan podido evolucionar de manera simultánea.

Fuente:

Behe, Michael J. 1996. Darwin's Black Box, New York: The Free Press, pp. 140-160

Respuesta

Aunque la síntesis de AMP se realiza en varios pasos en la vida moderna, no son necesarios. De hecho, la adenosina puede y se forma completamente fuera de cualquier forma de vida, tanto en solución acuosa ([Ferris_et_al_1984]) como en el espacio ([Kuzicheva_and_Gontareva_2002]). Las formas de vida primitivas pudieron haber usado AMP prebiótico y luego haber desarrollado gradualmente y refinado mecanismos para sintetizar AMP por ellas mismas.

La complejidad irreducible no es un obstáculo para la evolución.

Referencias

[Ferris_et_al_1984]

Ferris, J. P., H. Yanagawa, P. A. Dudgeon, W. J. Hagan Jr., and T. E. Mallare, 1984. The investigation of the HCN derivative diiminosuccinonitrile as a prebiotic condensing agent. The formation of phosphate esters. Origins of Life and Evolution of the Biosphere 15: 29-43.

[Kuzicheva_and_Gontareva_2002]

Kuzicheva, E. A. and N. B. Gontareva, 2002. Prebiotic synthesis of nucleotides at the Earth orbit in presence of Lunar soil. Advances in Space Research 30(6): 1525-1531.

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